The Single-Parameter Bragg–Williams Model for Eutectic Solvents
2025 Ozkilinc, O.; Soler, M. A.; Giannozzi, P.; Aparicio, S.; Fogolari, F.
Assessing the capability of in silico mutation protocols for predicting the finite temperature conformation of amino acids
2018 Ochoa, R.; Soler, M. A.; Laio, A.; Cossio, P.
Conformational Changes of Trialanine in Water Induced by Vibrational Relaxation of the Amide i Mode
2016 Bastida, A.; Zuniga, J.; Requena, A.; Miguel, B.; Candela, M. E.; Soler, M. A.
Distance-based configurational entropy of proteins from molecular dynamics simulations
2015 Fogolari, F.; Corazza, A.; Fortuna, S.; Soler, M. A.; Van Schouwen, B.; Brancolini, G.; Corni, S.; Melacini, G.; Esposito, G.
A consensus protocol for the: In silico optimisation of antibody fragments
2019 Soler, M. A.; Medagli, B.; Semrau, M. S.; Storici, P.; Bajc, G.; De Marco, A.; Laio, A.; Fortuna, S.
Genotype–phenotype correlations and disease mechanisms in PEX13-related Zellweger spectrum disorders
2022 Borgia, P.; Baldassari, S.; Pedemonte, N.; Alkhunaizi, E.; D'Onofrio, G.; Tortora, D.; Cali, E.; Scudieri, P.; Balagura, G.; Musante, I.; Diana, M. C.; Pedemonte, M.; Vari, M. S.; Iacomino, M.; Riva, A.; Chimenz, R.; Mangano, G. D.; Mohammadi, M. H.; Toosi, M. B.; Ashrafzadeh, F.; Imannezhad, S.; Karimiani, E. G.; Accogli, A.; Schiaffino, M. C.; Maghnie, M.; Soler, M. A.; Echiverri, K.; Abrams, C. K.; Striano, P.; Fortuna, S.; Maroofian, R.; Houlden, H.; Zara, F.; Fiorillo, C.; Salpietro, V.
A PAK1 Mutational Hotspot Within the Regulatory CRIPaK Domain is Associated With Severe Neurodevelopmental Disorders in Children
2023 Scorrano, G.; D'Onofrio, G.; Accogli, A.; Severino, M.; Buchert, R.; Kotzaeridou, U.; Iapadre, G.; Farello, G.; Iacomino, M.; Dono, F.; Di Francesco, L.; Fiorile, M. F.; La Bella, S.; Corsello, A.; Cali, E.; Di Rosa, G.; Gitto, E.; Verrotti, A.; Fortuna, S.; Soler, M. A.; Chiarelli, F.; Oehl-Jaschkowitz, B.; Haack, T. B.; Zara, F.; Striano, P.; Salpietro, V.
Locuaz: an in silico platform for protein binders optimization
2024 Barletta, G. P.; Tandiana, R.; Soler, M. A.; Fortuna, S.; Rocchia, W.
Understanding the connection between conformational changes of peptides and equilibrium thermal fluctuations
2017 Soler, M. A.; Zuniga, J.; Requena, A.; Bastida, A.
Molecular dynamics simulations and docking enable to explore the biophysical factors controlling the yields of engineered nanobodies
2016 Soler, M. A.; De Marco, A.; Fortuna, S.
Antibody-Antigen Binding Interface Analysis in the Big Data Era
2022 Reis, P. B. P. S.; Barletta, G. P.; Gagliardi, L.; Fortuna, S.; Soler, M. A.; Rocchia, W.
A homozygous MED11 C-terminal variant causes a lethal neurodegenerative disease
2022 Cali, E.; Lin, S. -J.; Rocca, C.; Sahin, Y.; Al Shamsi, A.; El Chehadeh, S.; Chaabouni, M.; Mankad, K.; Galanaki, E.; Efthymiou, S.; Sudhakar, S.; Athanasiou-Fragkouli, A.; Celik, T.; Narli, N.; Bianca, S.; Murphy, D.; De Carvalho Moreira, F. M.; Hannah, M. G.; Bugiardini, E.; Kriouile, Y.; El Khorassani, M.; Aguennouz, M.; Groppa, S.; Karashova, B. M.; Di Rosa, G.; Goraya, J. S.; Sultan, T.; Avdjieva, D.; Kathom, H.; Tincheva, R.; Banu, S.; Veggiotti, P.; Verrotti, A.; Savasta, S.; Ruiz, A. M.; Garavaglia, B.; Borgione, E.; Papacostas, S.; Compagnoni, C.; Piccirilli, A.; Vikelis, M.; Chelban, V.; Kaiyrzhanov, R.; Cortese, A.; Sullivan, R.; Papanicolaou, E. Z.; Dardiotis, E.; Maqbool, S.; Ibrahim, S.; Kirmani, S.; Rana, N. N.; Atawneh, O.; Lim, S. -Y.; Shaikh, F.; Scardamaglia, A.; Koutsis, G.; Mangano, S.; Scuderi, C.; Morello, G.; Zollo, M.; Heimer, G.; Striano, P.; Al-Khawaja, I.; Al-Mutairi, F.; Alkuraya, F. S.; Rizig, M.; Shashkin, C.; Zharkynbekova, N.; Koneyev, K.; Manizha, G.; Isrofilov, M.; Guliyeva, U.; Salayev, K.; Khachatryan, S.; Xiromerisiou, G.; Spanaki, C.; Tucci, A.; Fiorillo, C.; Rissotto, F.; Munell, F.; Gagliano, A.; Jan, F.; Chimenz, R.; Gitto, E.; Cuppari, C.; Romeo, C.; Magrinelli, F.; Gupta, N.; Kabra, M.; Benrhouma, H.; Tazir, M.; Zagaroli, L.; Caloisi, C.; Fabiano, C.; Bottone, G.; Farello, G.; Di Fabio, S.; Obeid, M.; Bakhtadze, S.; Saadi, N. W.; Zaki, M. S.; Triki, C. C.; Kara, M.; Belcastro, V.; Specchio, N.; Karimiani, E. G.; Salih, A. M.; Ramenghi, L. A.; David, E.; Curro, R.; Iezzi, M. L.; Iapadre, G.; Nanni, G.; Scorrano, G.; Fiorile, M. F.; Brancati, F.; Di Falco, G.; Mandara, L.; Barrano, G.; Elia, M.; Terrone, G.; Operto, F. F.; Valenzise, M.; Della Rocca, Y.; Zazzeroni, F.; Alesse, E.; Manti, F.; Galosi, S.; Nardecchia, F.; Leuzzi, V.; Pironti, E.; Amore, G.; Ceravolo, G.; Zafar, F.; Ullah, E.; Afzal, E.; Javed, I.; Rahman, F.; Ahmed, M. M.; Parisi, P.; Borgia, P.; Mangano, G. D.; Chiarelli, F.; Genomics, Q. S.; Andrea, Accogli; Petree, C.; Huang, K.; Monastiri, K.; Edizadeh, M.; Nardello, R.; Ognibene, M.; De Marco, P.; Ruggieri, M.; Zara, F.; Sahin, Y.; Al-Gazali, L.; Abi Warde, M. T.; Gerard, B.; Zifarelli, G.; Beetz, C.; Fortuna, S.; Soler Bastida, M.; Valente, E. M.; Varshney, G.; Maroofian, R.; Salpietro, V.; Houlden, H.
AMPA Receptor Modulation Through Medium-Chain Triglycerides and Decanoic Acid Supports Nutritional Intervention in Pediatric Epilepsy
2025 Falsaperla, R.; Sortino, V.; Soler, M. A.; Spatuzza, M.; Fortuna, S.; Salpietro, V.
Statistical accuracy of molecular dynamics-based methods for sampling conformational ensembles of disordered proteins
2024 Bastida, A.; Zuniga, J.; Fogolari, F.; Soler, M. A.
Computational evolution of beta-2-microglubulin binding peptides for nanopatterned surface sensors
2021 Adedeji Olulana, A. F.; Soler, M. A.; Lotteri, M.; Vondracek, H.; Casalis, L.; Marasco, D.; Castronovo, M.; Fortuna, S.
Effect of humanizing mutations on the stability of the llama single-domain variable region
2021 Soler, M. A.; Medagli, B.; Wang, J.; Oloketuyi, S.; Bajc, G.; Huang, H.; Fortuna, S.; De Marco, A.
Molecular electrostatics and pKa shifts calculations with the Generalized Born model. A tutorial through examples with Bluues2
2023 Soler, M. A.; Ozkilinc, O.; Hunashal, Y.; Giannozzi, P.; Esposito, G.; Fogolari, F.
Description of conformational ensembles of disordered proteins by residue-local probabilities
2023 Bastida, A.; Zuniga, J.; Miguel, B.; Soler, M. A.
Lipase-catalysed esterification in a reactive natural deep eutectic solvent leads to lauroylcholine chloride rather than glucose ester
2024 Buzatu, A. R.; Soler, M. A.; Ozkilinc, O.; Fortuna, S.; Dreava, D. M.; Bitcan, I.; Giannozzi, P.; Fogolari, F.; Gardossi, L.; Peter, F.; Todea, A.; Boeriu, C. G.
Enhanced Molecular Dynamics Method to Efficiently Increase the Discrimination Capability of Computational Protein-Protein Docking
2021 Scafuri, N.; Soler, M. A.; Spitaleri, A.; Rocchia, W.
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