SOLER BASTIDA, Miguel Angel
SOLER BASTIDA, Miguel Angel
Dipartimento di Scienze Molecolari e Nanosistemi
A consensus protocol for the: In silico optimisation of antibody fragments
2019-01-01 Soler, M. A.; Medagli, B.; Semrau, M. S.; Storici, P.; Bajc, G.; De Marco, A.; Laio, A.; Fortuna, S.
A homozygous MED11 C-terminal variant causes a lethal neurodegenerative disease
2022-01-01 Cali, E.; Lin, S. -J.; Rocca, C.; Sahin, Y.; Al Shamsi, A.; El Chehadeh, S.; Chaabouni, M.; Mankad, K.; Galanaki, E.; Efthymiou, S.; Sudhakar, S.; Athanasiou-Fragkouli, A.; Celik, T.; Narli, N.; Bianca, S.; Murphy, D.; De Carvalho Moreira, F. M.; Hannah, M. G.; Bugiardini, E.; Kriouile, Y.; El Khorassani, M.; Aguennouz, M.; Groppa, S.; Karashova, B. M.; Di Rosa, G.; Goraya, J. S.; Sultan, T.; Avdjieva, D.; Kathom, H.; Tincheva, R.; Banu, S.; Veggiotti, P.; Verrotti, A.; Savasta, S.; Ruiz, A. M.; Garavaglia, B.; Borgione, E.; Papacostas, S.; Compagnoni, C.; Piccirilli, A.; Vikelis, M.; Chelban, V.; Kaiyrzhanov, R.; Cortese, A.; Sullivan, R.; Papanicolaou, E. Z.; Dardiotis, E.; Maqbool, S.; Ibrahim, S.; Kirmani, S.; Rana, N. N.; Atawneh, O.; Lim, S. -Y.; Shaikh, F.; Scardamaglia, A.; Koutsis, G.; Mangano, S.; Scuderi, C.; Morello, G.; Zollo, M.; Heimer, G.; Striano, P.; Al-Khawaja, I.; Al-Mutairi, F.; Alkuraya, F. S.; Rizig, M.; Shashkin, C.; Zharkynbekova, N.; Koneyev, K.; Manizha, G.; Isrofilov, M.; Guliyeva, U.; Salayev, K.; Khachatryan, S.; Xiromerisiou, G.; Spanaki, C.; Tucci, A.; Fiorillo, C.; Rissotto, F.; Munell, F.; Gagliano, A.; Jan, F.; Chimenz, R.; Gitto, E.; Cuppari, C.; Romeo, C.; Magrinelli, F.; Gupta, N.; Kabra, M.; Benrhouma, H.; Tazir, M.; Zagaroli, L.; Caloisi, C.; Fabiano, C.; Bottone, G.; Farello, G.; Di Fabio, S.; Obeid, M.; Bakhtadze, S.; Saadi, N. W.; Zaki, M. S.; Triki, C. C.; Kara, M.; Belcastro, V.; Specchio, N.; Karimiani, E. G.; Salih, A. M.; Ramenghi, L. A.; David, E.; Curro, R.; Iezzi, M. L.; Iapadre, G.; Nanni, G.; Scorrano, G.; Fiorile, M. F.; Brancati, F.; Di Falco, G.; Mandara, L.; Barrano, G.; Elia, M.; Terrone, G.; Operto, F. F.; Valenzise, M.; Della Rocca, Y.; Zazzeroni, F.; Alesse, E.; Manti, F.; Galosi, S.; Nardecchia, F.; Leuzzi, V.; Pironti, E.; Amore, G.; Ceravolo, G.; Zafar, F.; Ullah, E.; Afzal, E.; Javed, I.; Rahman, F.; Ahmed, M. M.; Parisi, P.; Borgia, P.; Mangano, G. D.; Chiarelli, F.; Genomics, Q. S.; Andrea, Accogli; Petree, C.; Huang, K.; Monastiri, K.; Edizadeh, M.; Nardello, R.; Ognibene, M.; De Marco, P.; Ruggieri, M.; Zara, F.; Sahin, Y.; Al-Gazali, L.; Abi Warde, M. T.; Gerard, B.; Zifarelli, G.; Beetz, C.; Fortuna, S.; Soler Bastida, M.; Valente, E. M.; Varshney, G.; Maroofian, R.; Salpietro, V.; Houlden, H.
A method for analyzing the vibrational energy flow in biomolecules in solution
2011-01-01 Soler, M. A.; Bastida, A.; Farag, M. H.; Zuniga, J.; Requena, A.
A mutational hotspot in TUBB2A associated with impaired heterodimer formation and severe brain developmental disorders
2025-01-01 Di Pasquale, Gabriele; Colella, Jacopo; Di Cataldo, Carola P.; Soler, Miguel A.; Fortuna, Sara; Mizrahi-Powell, Emma; Nizon, Mathilde; Cognè, Benjamin; Turchetti, Valentina; Mangano, Giuseppe D.; Comisi, Francesco F.; Cecchetti, Corrado; Giliberti, Alessandra; Nardello, Rosaria; Pavone, Piero; Falsaperla, Raffaele; Di Rosa, Gabriella; Evrony, Gilad D.; Delvecchio, Maurizio; Severino, Mariasavina; Accogli, Andrea; Vittori, Alessandro; Salpietro, Vincenzo
A PAK1 Mutational Hotspot Within the Regulatory CRIPaK Domain is Associated With Severe Neurodevelopmental Disorders in Children
2023-01-01 Scorrano, G.; D'Onofrio, G.; Accogli, A.; Severino, M.; Buchert, R.; Kotzaeridou, U.; Iapadre, G.; Farello, G.; Iacomino, M.; Dono, F.; Di Francesco, L.; Fiorile, M. F.; La Bella, S.; Corsello, A.; Cali, E.; Di Rosa, G.; Gitto, E.; Verrotti, A.; Fortuna, S.; Soler, M. A.; Chiarelli, F.; Oehl-Jaschkowitz, B.; Haack, T. B.; Zara, F.; Striano, P.; Salpietro, V.
Accurate Estimation of the Entropy of Rotation-Translation Probability Distributions
2016-01-01 Fogolari, F.; Dongmo Foumthuim, C. J.; Fortuna, S.; Soler, M. A.; Corazza, A.; Esposito, G.
AMPA receptor GluA2 subunit defects are a cause of neurodevelopmental disorders
2019-01-01 Salpietro, V.; Dixon, C. L.; Guo, H.; Bello, O. D.; Vandrovcova, J.; Efthymiou, S.; Maroofian, R.; Heimer, G.; Burglen, L.; Valence, S.; Torti, E.; Hacke, M.; Rankin, J.; Tariq, H.; Colin, E.; Procaccio, V.; Striano, P.; Mankad, K.; Lieb, A.; Chen, S.; Pisani, L.; Bettencourt, C.; Mannikko, R.; Manole, A.; Brusco, A.; Grosso, E.; Ferrero, G. B.; Armstrong-Moron, J.; Gueden, S.; Bar-Yosef, O.; Tzadok, M.; Monaghan, K. G.; Santiago-Sim, T.; Person, R. E.; Cho, M. T.; Willaert, R.; Yoo, Y.; Chae, J. -H.; Quan, Y.; Wu, H.; Wang, T.; Bernier, R. A.; Xia, K.; Blesson, A.; Jain, M.; Motazacker, M. M.; Jaeger, B.; Schneider, A. L.; Boysen, K.; Muir, A. M.; Myers, C. T.; Gavrilova, R. H.; Gunderson, L.; Schultz-Rogers, L.; Klee, E. W.; Dyment, D.; Osmond, M.; Parellada, M.; Llorente, C.; Gonzalez-Penas, J.; Carracedo, A.; Van Haeringen, A.; Ruivenkamp, C.; Nava, C.; Heron, D.; Nardello, R.; Iacomino, M.; Minetti, C.; Skabar, A.; Fabretto, A.; Hanna, M. G.; Bugiardini, E.; Hostettler, I.; O'Callaghan, B.; Khan, A.; Cortese, A.; O'Connor, E.; Yau, W. Y.; Bourinaris, T.; Kaiyrzhanov, R.; Chelban, V.; Madej, M.; Diana, M. C.; Vari, M. S.; Pedemonte, M.; Bruno, C.; Balagura, G.; Scala, M.; Fiorillo, C.; Nobili, L.; Malintan, N. T.; Zanetti, M. N.; Krishnakumar, S. S.; Lignani, G.; Jepson, J. E. C.; Broda, P.; Baldassari, S.; Rossi, P.; Fruscione, F.; Madia, F.; Traverso, M.; De-Marco, P.; Perez-Duenas, B.; Munell, F.; Kriouile, Y.; El-Khorassani, M.; Karashova, B.; Avdjieva, D.; Kathom, H.; Tincheva, R.; Van-Maldergem, L.; Nachbauer, W.; Boesch, S.; Gagliano, A.; Amadori, E.; Goraya, J. S.; Sultan, T.; Kirmani, S.; Ibrahim, S.; Jan, F.; Mine, J.; Banu, S.; Veggiotti, P.; Zuccotti, G. V.; Ferrari, M. D.; Van Den Maagdenberg, A. M. J.; Verrotti, A.; Marseglia, G. L.; Savasta, S.; Soler, M. A.; Scuderi, C.; Borgione, E.; Chimenz, R.; Gitto, E.; Dipasquale, V.; Sallemi, A.; Fusco, M.; Cuppari, C.; Cutrupi, M. C.; Ruggieri, M.; Cama, A.; Capra, V.; Mencacci, N. E.; Boles, R.; Gupta, N.; Kabra, M.; Papacostas, S.; Zamba-Papanicolaou, E.; Dardiotis, E.; Maqbool, S.; Rana, N.; Atawneh, O.; Lim, S. Y.; Shaikh, F.; Koutsis, G.; Breza, M.; Coviello, D. A.; Dauvilliers, Y. A.; Alkhawaja, I.; Alkhawaja, M.; Al-Mutairi, F.; Stojkovic, T.; Ferrucci, V.; Zollo, M.; Alkuraya, F. S.; Kinali, M.; Sherifa, H.; Benrhouma, H.; Turki, I. B. Y.; Tazir, M.; Obeid, M.; Bakhtadze, S.; Saadi, N. W.; Zaki, M. S.; Triki, C. C.; Benfenati, F.; Gustincich, S.; Kara, M.; Belcastro, V.; Specchio, N.; Capovilla, G.; Karimiani, E. G.; Salih, A. M.; Okubadejo, N. U.; Ojo, O. O.; Oshinaike, O. O.; Oguntunde, O.; Wahab, K.; Bello, A. H.; Abubakar, S.; Obiabo, Y.; Nwazor, E.; Ekenze, O.; Williams, U.; Iyagba, A.; Taiwo, L.; Komolafe, M.; Senkevich, K.; Shashkin, C.; Zharkynbekova, N.; Koneyev, K.; Manizha, G.; Isrofilov, M.; Guliyeva, U.; Salayev, K.; Khachatryan, S.; Rossi, S.; Silvestri, G.; Haridy, N.; Ramenghi, L. A.; Xiromerisiou, G.; David, E.; Aguennouz, M.; Fidani, L.; Spanaki, C.; Tucci, A.; Raspall-Chaure, M.; Chez, M.; Tsai, A.; Fassi, E.; Shinawi, M.; Constantino, J. N.; De Zorzi, R.; Fortuna, S.; Kok, F.; Keren, B.; Bonneau, D.; Choi, M.; Benzeev, B.; Zara, F.; Mefford, H. C.; Scheffer, I. E.; Clayton-Smith, J.; Macaya, A.; Rothman, J. E.; Eichler, E. E.; Kullmann, D. M.; Houlden, H.
AMPA Receptor Modulation Through Medium-Chain Triglycerides and Decanoic Acid Supports Nutritional Intervention in Pediatric Epilepsy
2025-01-01 Falsaperla, R.; Sortino, V.; Soler, M. A.; Spatuzza, M.; Fortuna, S.; Salpietro, V.
Analysis of state-specific vibrations coupled to the unidirectional energy transfer in conjugated dendrimers
2012-01-01 Soler, M. A.; Roitberg, A. E.; Nelson, T.; Tretiak, S.; Fernandez-Alberti, S.
Antibody Affinity Maturation Using Computational Methods: From an Initial Hit to Small-Scale Expression of Optimized Binders
2023-01-01 Medagli, B.; Soler, M. A.; De Zorzi, R.; Fortuna, S.
Antibody-Antigen Binding Interface Analysis in the Big Data Era
2022-01-01 Reis, P. B. P. S.; Barletta, G. P.; Gagliardi, L.; Fortuna, S.; Soler, M. A.; Rocchia, W.
Assessing the capability of in silico mutation protocols for predicting the finite temperature conformation of amino acids
2018-01-01 Ochoa, R.; Soler, M. A.; Laio, A.; Cossio, P.
Binding affinity prediction of nanobody-protein complexes by scoring of molecular dynamics trajectories
2018-01-01 Soler, M. A.; Fortuna, S.; De Marco, A.; Laio, A.
Bluues_cplx: Electrostatics at Protein–Protein and Protein–Ligand Interfaces
2025-01-01 Soler Bastida, Miguel Angel; Rayyan Bassem Adel Yakout, ; Ozkilinc, Ozge; Esposito, Gennaro; Rocchia, Walter; Klein, Christian; Fogolari, Federico
Computational design of cyclic peptides for the customized oriented immobilization of globular proteins
2017-01-01 Soler, M. A.; Rodriguez, A.; Russo, A.; Adedeji, A. F.; Dongmo Foumthuim, C. J.; Cantarutti, C.; Ambrosetti, E.; Casalis, L.; Corazza, A.; Scoles, G.; Marasco, D.; Laio, A.; Fortuna, S.
Computational evolution of beta-2-microglubulin binding peptides for nanopatterned surface sensors
2021-01-01 Adedeji Olulana, A. F.; Soler, M. A.; Lotteri, M.; Vondracek, H.; Casalis, L.; Marasco, D.; Castronovo, M.; Fortuna, S.
Computational Evolution Protocol for Peptide Design
2022-01-01 Ochoa, R.; Soler, M. A.; Gladich, I.; Battisti, A.; Minovski, N.; Rodriguez, A.; Fortuna, S.; Cossio, P.; Laio, A.
Computational Mutagenesis of Antibody Fragments: Disentangling Side Chains from ΔΔG Predictions
2024-01-01 Tandiana, R.; Barletta, G. P.; Soler, M. A.; Fortuna, S.; Rocchia, W.
Conformational Changes of Trialanine in Water Induced by Vibrational Relaxation of the Amide i Mode
2016-01-01 Bastida, A.; Zuniga, J.; Requena, A.; Miguel, B.; Candela, M. E.; Soler, M. A.
Description of conformational ensembles of disordered proteins by residue-local probabilities
2023-01-01 Bastida, A.; Zuniga, J.; Miguel, B.; Soler, M. A.